Mistérios de Lisboa mergulha em uma mundo de aventuras e revelações que viajam de Portugal até o Brasil, passando por França e Itália no século 19. Pedro da Silva é órfão de um internato religioso em Lisboa, em seu caminho está Padre Dinis, um descendente de aristocratas libertinos que terá de lidar com uma condessa enlouquecida pelo seu ciúme e um homem de negócios disposto a tudo pelo dinheiro.