No centro dessa história de Munique está Avner (Eric Bana), o jovem patriota israelense e oficial da inteligência. Ainda de luto pelo massacre e enfurecido por sua selvageria, ele recebe uma missão: abandonar a mulher grávida de seu primeiro filho e sua identidade para caçar e matar os 11 homens acusados pela inteligência de Israel de planejarem os assassinatos. Apesar de sua juventude e inexperiência, Avner logo se torna o líder de uma equipe de quatro recrutas. Juntos, eles partem em buscar de cada um dos nomes de uma lista secreta. À medida que cresce o desejo por justiça, surgem questionamentos quanto ao motivo e conseqüência desses atos.

A história interpretada por Eric Bana é baseada em A Hora da Vingança, livro do canadense George Jonas, sobre relatos do agente Avner Kauffman, um dono de empresa de segurança em Nova York. Segundo Spielberg, que não quis se pronunciar sobre o filme até a estréia, Jonas é apenas uma de muitas fontes que teve para compor Munique. O filme foi indicado para duas categorias (Melhor Diretor e Roteiro) no Globo de Ouro 2006.