Um grande acervo de antropologia, zootecnia, numismática (moedas), malacologia (estudo de moluscos), rochas e vestes religiosas faz parte do Museu do Homem do Sambaqui. No local há ainda exposição de esqueletos humanos datados de mil anos.

A construção, tombada pelo Governo Federal e Estadual, localiza-se no Colégio Catarinense, um complexo histórico centenário. O museu é especializado em arqueologia pré-histórica e possui peças de até oito mil anos, entre instrumentos e artefatos indígenas, esqueletos e fragmentos cerâmicos. Existe também uma área de zootecnia, numismática e de vestes litúrgicas.

Obs: as visitas devem ser agendadas para no máximo 25 pessoas.